FASTASeq 300、GenoLab M、SURFSeq 5000将为您提供:
●?高集成度:DNA模板扩zeng与合成测序反映集成于测序芯片外貌举行。样品制备完成后即可直接上机,实现扩zeng测序流程一体化。
●?高准确性:奇异的可逆终止碱基和测序反映系统,合成反映效聅hi案弑U娑,团结高迅速度的荧光信号检测系统,最大化测序准确率,现在测序准确率已经到达业内领先水平。
●?高兼容性:创新性的外貌化学修饰,团结高度兼容的引物讨论,可无缝适配市面常见的?NGS文库系统,稳固高效,用户无需重新开发样本制备试剂盒。
●?多种通量团结:用户凭证自shen应用需求无邪搭配相关测序试剂盒。
●?成本可控:国产测序平台,仪器及检测成内情比入口品牌有显著优势。
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应用案例
基于FASTASeq 300人全外显子组重测序
样本类型:基于HG001(NA12878)、HG002(NA24835)构建Agilent SureSelect Human All Exon V6文库HG001-WES、HG002-WES;
测序战略:HG001-WES、HG002-WES文库划分使用FASTASeq 300、GenoLab M、NV测序平台举行PE150测序,划分抽取12Gb数据举行剖析;
测试效果:三个测序平台检测SNV的迅速度、准确度、F1-Score均高达99%以上;检测InDel的迅速度均高达99%以上、准确度和F1-Score均到达了85%以上;
测试结论:FASTASeq 300在生殖细胞突变(SNV和InDel)检测的迅速度和准确度上体现优异。
基于GenoLab M人全外显子组重测序
样本类型:基于NA12878细胞系构建Agilent SureSelect Human All Exon V6 WES文库(Panel Size: 60Mb);
测序战略:统一个外显子文库划分在 GenoLab M、NV和NX测序平台举行PE150测序,GenoLab M平台举行3ci重复测序,划分抽取12Gb数据举行剖析;
测试效果:三个测序平台在SNP和InDel检测的准确度和迅速度上体现一致,GenoLab M平台检测SNP和InDel的准确度划分到达了99%及88%以上,迅速度划分到达了99%与91%以上;
测试结论:GenoLab M 平台测序质量优异且稳固、基因组目的区域笼罩均一性好、数据有用率高。
基于SURFSeq?5000人全外显子组重测序
样本类型:使用Agilent SureSelect Human All Exon V6基于HG001~HG005构建5个WES文库;
测序战略:HG001~HG005 WES文库划分使用SURFSeq 5000(SF)、NV测序平台举行PE150测序,每样本接纳~100×有用测序深度数据举行剖析;
测试效果:在Q30、比对率、笼罩度等指标上,SF和NV两平台性能相近;SURFSeq 5000 HG001~HG005 WES SNP突变检出的F1-Score均≥99.4%(高于NV平台),InDel突变检出的F1-Score均≥89.1%(高于NV平台);
测试结论:SURFSeq 5000在生殖细胞突变(SNV和InDel)检测的迅速度和准确度上体现优异。
基于SURFSeq 5000人全基因组重测序
样本类型:基于GIAB HG001~HG005构建5个WGS PCR-Free文库;
测序战略:划分使用SURFSeq 5000(SF)、NV测序平台举行PE150测序,接纳~30×有用测深数据举行秠uan绕饰觯
测试效果:在生殖细胞突变检测层面,SURFSeq 5000平台HG001~HG005 SNV F1-Score均值为99.27%(高于NV平台),InDel F1-Score均值为95.52%(高于NV平台);
测试结论:SURFSeq 5000在生殖细胞突变(SNV和InDel)检测的迅速度和准确度上体现优异。
GenoCare 1600将为您提供(仅适用于NIPT、CNV-seq):
●?一体化的测序剖析平台:测序数据自动导入生物信息剖析系统,直接出具检测效果;
●?检测效果准确可靠:GenoCare 1600特有的单分子检测手艺,无需PCR扩zeng,阻止由于GC偏好带来的测序误差,降低信息剖析重大度,提升检测迅速度和特异性;
●?检测速率快:从样品到出具检测陈诉可在一天内完成;
●?通量无邪:凭证样本量无邪选择通道数,无论是单个样本照旧批量样本均可无邪处置赏罚。
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应用案例
基于GenoCare 1600染色体拷贝数变异筛查(CNV-seq)
基于GenoCare 1600单分子基因测序仪,对9种差异拷贝数变异的细胞系gDNA样本举行 CNV-Seq检测,每种细胞系样本重复3ci,其检测效果与Affymetrix CytoScan 750K 微阵列检测效果100%一致。
GenoCare?1600CNV-Seq检测流程在样本制备及测序历程无PCR扩zeng偏向的引入,且测序数据经仪器自带的GC偏好校正软件校正后,可进一步提升检测效果的准确度和迅速度。
相关文献:
1.?Systematic evaluation of multiple NGS platforms for structural variants detection[J].Journal of Biological Chemistry,2023.
2.?Accuracy benchmark of the GeneMind GenoLab M sequencing platform for WGS and WES analysis[J].BMC genomics,2022.
3.?Non-invasive Prenatal Screening for Common Fetal Aneuploidies by Single Molecular Sequencing[J].Laboratory Investigation,2022.
4.?Prenatal diagnosis of a trisomy 7 mosaic case: CMA, CNV-seq, karyotyping, interphase FISH, and MS-MLPA, which technique to choose?[J].BMC Pregnancy and Childbirth,2024.
5.?Assessing the impact of sequencing platforms and analytical pipelines on whole-exome sequencing[J].Frontiers in Genetics,2024.