SURFSeq 5000为用户提供Balanced Mode(BM,平衡模式)和Enhanced Mode(EM,zeng强模式)两大Q40测序模式。
??在Balanced Mode下,SURFSeq 5000可实现≥90% bases≥Q30,≥85% bases≥Q40。
??在Enhanced Mode下,SURFSeq 5000可实现≥95% bases≥Q30,≥90% bases≥Q40。
*Q30/Q40%基于壹定发?物企业尺度品文库多轮测试效果的中位数值设定,gai数值受到样本状态、?库质量和定量准确性等因素的影响而发生转变。
??Balanced Mode是平衡数据质量和芯片使用率的最优解。在gai模式下,壹定发统计了近3个?,SURFSeq 5000FCH芯片7大类应用偏向共116轮的测试数据。其中100轮Balanced Mode PE150测序数据的Q30、Q40均值达划分到达了95.1%和91.3%,Output reads均值到达了2500M reads(官标2000M reads)。
??全新的Enhanced Mode在Balanced Mode的基础上,加入了基于机械学习构建的序列特征模子等多维信息,全新的“3D Basecall”可更周全的识别测序历程中的“问题序列区域”,并更准确地举行碱基识别和Q值打分。统计16轮Enhanced Mode下WGS PE150测序数据,Q30、Q40均值达划分到达了97.1%和95.2%,Output reads均值到达了2350M reads。
*在数据产量Output reads方面,Enhanced Mode相比Balanced Mode会有5%±2%水平的降低(gai差异水平依据为“对相同原shi图像划分使用两种模式下basecall算法获得的数据差值”),降低比例受到样本状态、文库构建方式及质量和文库定量精准度等因素影响。